2010-01-01から1年間の記事一覧

オープンソース・バイオロジー 1

2001年、すでに「オープンソース・バイオロジー」が話題になっています。 Wired Visionに掲載されているドルー・エンディー Drew Endy 助教授のコメント"生物学におけるアプリケーション――オペレーティング・システム(OS)から遺伝子データベースに至るまで――…

遺伝子組み換え技術

遺伝子組み換え技術 遺伝子組み換え技術。(Wikipedia, Recombinant_DNAより。) 遺伝子の切り貼り 制限酵素が発見、応用されるようになって、幅広い効率的なDNA操作が可能になりました。1960年代にEcoRIとDNAリガーゼが発見されて以来、様々な制限酵素が次々…

PCR

DNA増幅法 PCRサイクル(Wikipedia, PCRより。)ゲノムDNAなどをテンプレートに、増幅したい領域の両端にプライマーと呼ばれるテンプレートと相補対をなす短いDNA断片そして耐熱性DNAポリメラーゼを用いてサイクル反応(プライマーとのアニーリング→伸長反応→…

バイオに関わる3種類の危険性

バイオに関わるリスクは3種類に大別されます。1.自然発生するもの インフルエンザやHIV等の世界各国多数の人々が被害を受け、死に至る病気がこれに相当します。被害をおさえるにはこの治療のみならず、予防、検出、観測が不可欠です。 2.予期せぬ結果 研究…

DIYbio on BBC

DIYbioに関わる人々は"バイオハッカー"と呼ばれている。しかし、ベッドルームバイオテクノロジストと呼んだ方がいいかもしれない。彼らはDNAをコピーすることができ、遺伝子組み換え細菌を培養することができ、間に合わせのラボからでも遺伝子検査を実施こと…

iGEM作品集

iGEM作品 Pick Up! Go to iGEM page 過去のiGEMチームの作品を順次ピックアップしていきます。 日本 大阪大学 09 京都工芸繊維大学 10 世界 UT Austin 04

マリオ、走る!

iGEM作品 Pick Up! Go to iGEM page 大阪大学のiGEMチームの作品 大阪大学が2009年のiGEM大会で発表した作品。蛍光タンパク質を発現するバクテリアを作りプレート上に並べられています。(Popsciより。)

バクテリアフォト

iGEM作品 Pick Up! Go to iGEM page UT AustinのiGEMチームの作品 2004年のUT Austinチームの作品です。iGEM史上で最もインパクトのあった作品の一つで、この研究を発展させた成果はNature紙にも掲載されました。光が当たると(培地が)黒くなるようにE. coli…

発展途上国とオープンソースバイオテクノロジー

Opportunities for Open Source Biotechnology in Underdeveloped Countries Google Tech Talks発展途上国(ベネズエラなど)での発展とイノベーションについて。安価なバイオテクノロジーが、学問の領域にとどまるのではなく、人々の生活に役立つ。

DIYbio DNA合成

DNA合成 遺伝子人工合成 遺伝子人工合成は、鋳型となるDNAを必要とすることなくin vitroで遺伝子を合成するプロセスのことです。主に、デジタルな遺伝子配列からオリゴヌクレオチドを合成、得られたフラグメントにその後アニーリングすることで、目的の二本…

DIYbio DNAシークエンシング

DNAシークエンシングとは DNAシークエンシングとは、DNAを構成するヌクレオチドの結合順序(塩基配列)を決定することである。DNAは生物の遺伝情報のほとんど全てを担う分子であり、基本的には塩基配列の形で符号化されているため、DNAシークエンシングは遺…

DIYbio 環境:コミュニティ、設備、制度

コミュニティ、ホームページ等組織 団体 BioBrick DIYbio DIYBio NYC GENOMIKON Genspace iGEM London Hackspace MolecularStation SoCal DIYbio Science House Synthetic Biology Blog biohacker BiologiGaragen DIY BIO 4 Beginners synthesis

DIYbio DIYツール

DIYbioツールボックスバイオ系の活動に最も重要となるのは、研究開発のためのツールです。DIYとしてオープンソース化の流れやDIYbio活発化の中で、使える、作れる装置がいろいろと開発されています。 実験装置マイクロ流体デバイス バイオ・化学分析をミクロ…

DIYbio コンピュータ関連/情報処理

DIYbio 生物/生化学物質

DIYbio 目的

DIYバイオの目標と方向性DIYバイオは現在始まったばかりの活動です。現在の主な目標はその活動の基盤を整備することで、例えばDIYbio.orgのメーリングリストでは活発な議論が常に交わされています。この基盤が整うにつれ、DIYバイオの活動もより多様化してく…

合成バイオロジー作品集 その他

個人ベース バクテリア 雨のにほひ

More about Biotic Games、バイオゲーム

バイオゲームとは ゲームを通じてバイオに触れる バイオゲームとはその名の通り「バイオ」「生物学的プロセス」を題材としたゲームである。現在、アメリカを中心にして細胞をコントロールするものや分子の動きを予想するものなど、様々なテーマ、様々なレベ…

More about システム生物学

システム生物学とは システム生物学のイメージ:生物システムの観測+網羅的解析+数理モデル (Technische Universiteit Eindhovenのサイトより。) 技術の発達が生物「システム」の解析を可能に ここに出てきたシステム生物学は、生命現象のシステム的な特徴…

合成バイオロジーに纏わる安全・倫理の問題

合成生物学は様々な可能性を秘めています。特に、産業応用の面ではバイオベースの物質生産が注目を浴びています。微生物の代謝経路を改変、新規構築し、ターゲット物質の生産を最適化するという試みは至る所で見られます。薬、栄養素、そしてエネルギー源と…

合成バイオロジーに関する話題

合成バイオロジーに関する話題合成バイオロジーとは 5分で分かる合成バイオロジー 10分で分かる合成バイオロジー 「In vitro」合成バイオロジー DNA合成、配列解析 安くなったDNA 合成バイオロジー関連のニュース、論文 多重ゲノム工学 Breakthrough of the …

More about バイオアート

バイオアートとはアートとライフサイエンス 研究室やアーティストのスタジオで、バイオテクノロジーを用いて、ライフサイエンスに関する素材を使って生み出される芸術作品です。バイオアーティストと呼ばれる人たちは、遺伝子工学、組織培養、クローニング等…

Introduction to Biotech

生物工学入門生物工学とは 生物学を応用し実社会に役立てる技術の総称です。バイオテクノロジーとも呼ばれる。近年では遺伝子組み換え技術を用いた遺伝子工学を指すことも多いです。そして近年の生物工学は生化学と分子生物学の発展とともに急速に進化してき…

Bioinformatics

バイオインフォマティクスとは 生物と情報 統計学、コンピューターサイエンスなどを応用して生物学、特に分子生物学関連の諸問題を解決しようとする分野です。もともと「バイオインフォマティクス」という言葉は、生物システムの情報の流れを研究する分野を…

What's New!?

DIYバイオの最新の情報および興味を引くニュース 主に海外のニュースを紹介していきます。DIYbio アジアにおけるDIYbio活動@シンガポール FutureLabCamp オープンPCR出荷へ 禅の空間 DIYbio on BBC 元記事へのリンク 2011/02/04: ...DIYbioはパソコン登場初…

Systems Biotechnology

システム生物工学とは / システム生物学とは システム生物工学とは生物システムを応用する 生物や生化学を中心に置き生物システムを応用しようとする分野です。Systems BiotechnologyないしはBiological Systems Engineeringと呼ばれ他にもさまざまな定義が…

Biotic Games

バイオゲームとは ゲームを通じてバイオに触れる バイオゲームとはその名の通り「バイオ」「生物学的プロセス」を題材としたゲームである。現在、アメリカを中心にして細胞をコントロールするものや分子の動きを予想するものなど、様々なテーマ、様々なレベ…

Synthetic Biology

合成バイオロジーとは「つくる」バイオロジー 産業応用を目指して、生命の理解を目指して、生物システムを新規構築しようというのがSynthetic Biologyです。日本ではよく合成バイオロジーもしくは合成生物学と訳されます。従来のバイオテクノロジーに工学原…

BioArt

バイオアートとはアートとライフサイエンス 研究室やアーティストのスタジオで、バイオテクノロジーを用いて、ライフサイエンスに関する素材を使って生み出される芸術作品です。バイオアーティストと呼ばれる人たちは、遺伝子工学、組織培養、クローニング等…

DIYbio & Biohacking

DIYbioとはDIYbio、オープンなバイオを目指して 研究室を離れたところで、オープンかつ安全なバイオに価値を見出す科学、生物学、生物工学を探求する人々が世界中にいます。そうした人々が集まり、生物学「バイオ」を一般の人々が追求できるものにしよう、追…