f(DNA>RNA) x f(RNA>Protein) = f(DNA>RNA>Protein)

Systems Biotechnology


セルフリーの論文

大腸菌由来の転写、翻訳の生合成機構、mRNAとタンパク質の分解機構を備えた無細胞(セルフリー)システムを使って、完全な遺伝子発現プロセスを再現。各プロセスの数式を組み合わせると、システム全体を記述できることを確認。

(Coarse-Grained Dynamics of Protein Synthesis in a Cell-Free System. Eyal Karzbrun et al. Phys. Rev. Lett. 106, 048104 (2011))


Coarse-Grained Dynamics
Granularity(粒度)とは システム(もしくはシステムの記述方法)の解像度。地図で言えば、1m単位で見るか1kmの単位で見るか。

the extent to which a system is broken down into small parts, either the system itself or its description or observation

Wikipedia

ライフサイエンスの分野では、粗視化モデル(Coarse-graining nidel)は(脂質膜やDNA、タンパク質など)多くの生物学的プロセスに重要なスケールの時間でのダイナミクスを調べるために開発されている。